Kit Deteksi Asam Nukleat Virus Corona Baru (SARS-Cov-2).
New Coronavirus(SARS-Cov-2) Nucleic Acid Detection Kit
(Flubijihscent RT-PCR Probe Method) Product Manual
【Product name 】Kit Deteksi Asam Nukleat Virus Corona Baru (SARS-Cov-2) (Metode Pemeriksaan RT-PCR Fluoresen)
【Packaging specjikacations 】25 Tes/Perangkat
【Intended ususia】
Kit ini digunakan untuk deteksi kualitatif asam nukleat dari virus corona baru pada usap nasofaring, usap orofaring (tenggorokan), usap hidung anterior, usap mid-turbinate, bilas hidung, dan aspirasi hidung dari individu yang diduga mengidap COVID19 oleh penyedia layanan kesehatannya. Deteksi gen ORF1ab dan N dari virus corona baru dapat digunakan untuk diagnosis tambahan dan pemantauan epidemiologi infeksi virus corona baru.
【Principles of the prasdure 】
Kit ini dirancang untuk probe TaqMan spesifik dan primer spesifik yang dirancang untuk rangkaian gen ORF1ab dan N virus corona baru (SARS-Cov-2). Solusi reaksi PCR berisi 3 set primer spesifik dan probe fluoresen untuk mendeteksi target secara spesifik, dan satu set tambahan primer spesifik dan probe fluoresen digunakan sebagai kontrol standar internal kit untuk mendeteksi gen rumah tangga endogen.
Prinsip pengujiannya adalah probe fluoresen spesifik dicerna dan didegradasi oleh aktivitas eksonuklease enzim Taq dalam reaksi PCR, sehingga gugus fluoresen pelapor dan gugus fluoresen padam dipisahkan, sehingga sistem pemantauan fluoresensi dapat menerima fluoresensi. sinyal, dan kemudian Melalui efek pengayaan amplifikasi PCR, sinyal fluoresensi probe mencapai nilai ambang batas yang ditetapkan-nilai Ct (Ambang batas siklus). Dalam kasus tidak ada amplikon target, kelompok pelapor dari probe dekat dengan kelompok pendinginan. Pada saat ini terjadi transfer energi resonansi fluoresensi, dan fluoresensi kelompok reporter dipadamkan oleh kelompok pendinginan, sehingga sinyal fluoresen tidak dapat dideteksi oleh instrumen PCR fluoresen.
Untuk memantau penggunaan reagen selama pengujian, kit dilengkapi dengan kontrol positif dan negatif: kontrol positif berisi plasmid rekombinan lokasi target, dan kontrol negatif adalah air sulingan, yang digunakan untuk memantau pencemaran lingkungan. Disarankan untuk mengatur kontrol positif dan kontrol negatif secara bersamaan saat pengujian.
【Main components 】
Cat. No. | BST-SARS-25 | BST-SARS-DR-25 | Komponenmasuk | |
Namae | Spesifikasiifikasi | Bergalahitas | Bergalahitas | |
Kontrol positif | 180 μL/botol | 1 | 1 | Plasmid yang dibuat secara artifisial, Air suling |
Kontrol negatif | 180 μL/botol | 1 | 1 | Air suling |
Campuran SARS-Cov-2 | 358,5 μL/botol | 1 | / | Pasangan primer spesifik, probe fluoresen deteksi spesifik, dNTP, MgCl2, KCl, Tris-Hcl, air sulingan, dll |
Campuran Enzim | 16,5 μL/botol | 1 | / | Enzim Taq, reverse transkriptase, enzim UNG, dll. |
Campuran SARS-Cov-2 (Liofilis) | 25 tes/botol | / | 1 | Pasangan primer spesifik, probe fluoresen deteksi spesifik, dNTP, enzim Taq, transkriptase balik, air suling, dll. |
2x Penyangga | 375 μL/botol | / | 1 | MgCl2, KCl, Tris-Hcl, Air suling, dll. |
Catatan:(1) Komponen dalam kit batch yang berbeda tidak dapat dicampur atau ditukar.
(2) Siapkan reagen Anda sendiri: Kit ekstraksi asam nukleat.
【Storage condituons Dan expiration date 】
For BST-SARS-25:Transportasi dan simpan pada -20±5℃ untuk waktu yang lama.
For BST-SARS-DR-25:Transportasi pada suhu kamar. Simpan pada -20±5℃ untuk waktu yang lama.
Hindari siklus pembekuan-pencairan yang berulang. Masa berlaku sementara ditetapkan selama 12 bulan.
Lihat label untuk tanggal pembuatan dan penggunaan.
Setelah pembukaan pertama, reagen dapat disimpan pada suhu -20±5 °C tidak lebih dari 1 bulan atau sampai akhir masa pakai reagen, tanggal mana pun yang lebih dulu, untuk menghindari siklus pembekuan-pencairan berulang, dan jumlah pembekuan reagen. -siklus pencairan tidak boleh melebihi 6 kali.
【Applicable instrument】ABI 7500, SLAN-96P, Roche-LightCycler-480.
【Sample requirements 】
1. Jenis sampel yang berlaku: Larutan asam nukleat yang diekstraksi.
2. Penyimpanan dan pengangkutan sampel: Simpan pada suhu -20±5℃selama 6 bulan. Bekukan dan cairkan sampel tidak lebih dari 6 kali.
【Tperkiraaning method】
1.Nucleic acid extraction
Pilih kit ekstraksi asam nukleat yang sesuai untuk mengekstrak asam nukleat virus, dan ikuti petunjuk kit yang sesuai. Disarankan untuk menggunakan kit ekstraksi dan pemurnian asam nukleat yang diproduksi oleh Yixin Bio-Tech (Guangzhou) Co., Ltd. atau kit pemurnian asam nukleat yang setara.
2. Rmasing-masingtion reagent preparation
2.1 For BST-SARS-25:
(1) Keluarkan Campuran SARS-Cov-2 dan Campuran Enzim, lelehkan seluruhnya pada suhu kamar, aduk rata dengan alat Vortex lalu sentrifugasi sebentar.
(2) Campuran Enzim 16,5uL ditambahkan ke dalam 358,5uL Campuran SARS-Cov-2 dan diaduk rata untuk mendapatkan larutan reaksi campuran.
(3) Siapkan tabung oktal PCR 0,2 mL yang bersih dan tandai dengan 15uL larutan reaksi campuran di atas per sumur.
(4) Tambahkan 15 μL larutan asam nukleat murni, kontrol positif dan kontrol negatif, dan tutup dengan hati-hati tutup tabung oktal.
(5) Aduk rata dengan cara membalikkannya, dan segera sentrifugasi untuk memusatkan cairan di dasar tabung.
1
2.2 For BST-SARS-DR-25:
( 1) Tambahkan 375ul 2x Buffer ke dalam Campuran SARS-Cov-2((Lyophilized) untuk menyiapkan campuran reaksi. Aduk rata dengan memipet lalu sentrifugasi sebentar. (Setelah campuran reaksi disiapkan, disarankan untuk menyimpannya pada suhu -20℃ penyimpanan jangka panjang.)
(2) Siapkan tabung oktal PCR 0,2 mL yang bersih dan tandai dengan 15μL campuran reaksi per sumur.
(3) Tambahkan 15μL larutan asam nukleat murni, kontrol positif dan kontrol negatif, dan tutupi tutup tabung oktal dengan hati-hati.
(4) Aduk rata dengan cara membalikkannya, dan segera sentrifugasi untuk memusatkan cairan di dasar tabung.
3. PCR amphidupcation (Silakan merujuk ke manual instrumen untuk pengaturan pengoperasian.)
3. 1 Tempatkan tabung PCR 8 ke dalam ruang sampel instrumen PCR fluoresen, dan atur sampel yang akan diuji, kontrol positif dan kontrol negatif sesuai urutan pemuatan.
3.2 Saluran deteksi fluoresensi:
(1) Gen ORF1ab memilih saluran deteksi FAM (Reporter: FAM, Quencher: Tidak Ada).
(2) Gen N memilih saluran deteksi VIC (Reporter: VIC, Quencher: Tidak Ada).
(3) Gen standar internal memilih saluran deteksi CY5 (Reporter: CY5, Quencher: Tidak Ada).
(4) Referensi Pasif diatur ke ROX.
3.3 Pengaturan parameter program PCR:
Melangkah | Suhu (℃) | Waktu | Jumlah siklus | |
1 | Reaksi transkripsi terbalik | 50 | 15 menit | 1 |
2 | Aktivasi enzim Taq | 95 | 2,5 menit | 1 |
3 | Aktivasi enzim Taq | 93 | 10 detik | 43 |
Ekstensi anil dan akuisisi fluoresensi | 55 | 30 detik |
Setelah pengaturan, simpan file dan jalankan program reaksi..
4.Results analysis
Setelah program berakhir, hasilnya disimpan secara otomatis, dan kurva amplifikasi dianalisis. Kurva amplifikasi diatur ke ambang batas default instrumen.
【Explanation of test resuitu 】
1. Tentukan validitas percobaan: FAM kontrol positif, saluran VIC harus memiliki kurva amplifikasi yang khas, dan nilai Ct umumnya kurang dari 34, tetapi dapat berfluktuasi karena pengaturan ambang batas yang berbeda pada instrumen yang berbeda. Kontrol negatif FAM, saluran VIC harus berupa Ct yang tidak diperkuat. Disepakati bahwa persyaratan di atas harus dipenuhi pada saat yang sama, jika tidak, tes ini tidak valid.
2. Hasil penilaian
Saluran FAM/VIC | Hasil penilaian |
CT<37 | Tes sampel positif |
37≤Ct<40 | Kurva amplifikasi berbentuk S, dan sampel yang mencurigakan perlu diperiksa ulang; jika hasil pemeriksaan ulang konsisten maka dinilai positif, sebaliknya negatif |
Ct≥40 Atau Tanpa Amplifikasi | Tes sampel negatif (atau di bawah batas bawah deteksi kit) |
Catatan: (1) Jika saluran FAM dan saluran VIC keduanya positif pada saat yang sama, maka SARS-Cov-2 dinyatakan positif.
(2) Jika saluran FAM atau saluran VIC positif dan saluran lainnya negatif, pengujian harus diulang. Jika pada saat yang sama positif maka akan dinilai positif SARS-Cov-2, jika tidak maka akan dinilai negatif SARS-Cov-2.